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name: cell-manuscript-editing
description: >-
  深度润色已有英文科研论文，在尽量保留作者原意、数据、科学判断和表达习惯的前提下，
  改善英文准确性、论证逻辑、证据与结论匹配、段落结构和术语一致性，并减少模板化、
  宣传式和模型化表达，使文本保持真实作者声音。
  适用于英文论文润色、修改 Introduction/Methods/Results/Discussion/Conclusion、
  检查过度推断、按作者风格改稿、论文去 AI 感/去 AI 味/humanize，以及把作者已有中文内容
  忠实转写为学术英文；这里的自然化是写作质量改进，不用于推断作者身份或规避 AI 检测；
  不用于脱离已有研究内容从零写论文、处理审稿回复、撰写文献综述或准备投稿包。
metadata:
  compatibility: >-
    需要读取用户提供的英文稿及完成判断所需的上下文、图表或引文。
    文档编辑依赖宿主已有的对应文档能力；作者风格 profile 校验仅需 Python 3.10+ 标准库。
  version: "1.2.0"
  language: "zh-CN"
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# 英文科研论文深度润色

让修改后的英文仍像作者本人写的，只是科学含义更准确、逻辑更清楚、证据边界更严密、语言更符合正式期刊表达。修改优先级为：科学准确性、论证逻辑、证据匹配、信息完整性、段落结构、语言准确性、流畅度、文风美化。

用户未另行指定时，默认以短句和中等长度句为主，一个句子尽量承载一个核心判断。只在多层从句、插入语或多重逻辑妨碍阅读时拆句，不按固定字数切句，也不把全文改成碎短句。逐句核对语法，并按动作时间和句子功能选择时态；用户在当前任务提出的新风格要求优先。

## 使用边界

先锁定用户要求的范围，不把局部润色升级为全文重写。

- `language_edit`：修改语法、用词、简洁性和衔接；发现严重科学或逻辑风险时另行指出。
- `logic_edit`：在指定范围内修复论证顺序、证据链、替代解释和结论强度。
- `audit`：只报告问题、风险和建议，不直接改原文。
- `translation_edit`：把作者已有中文研究内容忠实转写为英文，不逐字翻译，也不增加原意之外的信息。
- `comprehensive_edit`：只有用户明确要求全面润色时，才同时处理结构、逻辑、证据和语言。

缺少可供润色或忠实转写的原文、研究事实与必要上下文时，不从常识补写论文内容。完整综述使用 `cell-review`；审稿回复使用 `cell-reviewer-response`；定稿后的期刊格式和投稿材料使用 `cell-submission`。

## 按需读取

- 所有实际润色都读取 [科学保真与结论强度](references/scientific-integrity.md) 和 [英文学术表达](references/english-editing.md)。
- 所有实际润色都读取 [英文学术文本自然化流程](references/humanization-pass.md)；其中的模式只用于定位待审表达，不用于推断作者身份或规避 AI 检测。
- 涉及逻辑、Discussion、全面润色或证据审查时，读取 [论证与证据链](references/argument-and-evidence.md)。
- 润色完整章节或全文时，读取 [分章节标准](references/section-specific-editing.md)。
- 用户提供历史改稿、明确偏好或要求全文保持同一风格时，读取 [作者风格校准](references/author-style-calibration.md)。

## 不可改变的事实

未经明确证据，不改变数据、数值、单位、样本和组别身份、研究阶段、实验条件、方法、统计结果、效应方向、图表编号、引文身份和专业实体名称。不能把相关改成因果，把可能性改成确定性，把局部结果推广为普遍规律，或补造数据、机制、作者观点和文献。

原文存在歧义时使用最保守且最接近原意的英文，并标出会影响科学判断的未决点。语言更自然不是提升结论强度的理由。

## 润色流程

### 1. 锁定输入和范围

读取指定原文及完成判断所需的相邻段落、图表、引文或作者说明。明确论文部分、润色模式、允许调整范围和必须保留的术语。文件任务保留原件，在副本上工作；不能只根据摘要或文件名判断全文。

### 2. 先理解再修改

识别文本要回答的科学问题、核心判断、直接观察、解释、进一步推论和重要判断的证据来源。先处理逻辑与证据层级，再调整英文；不能用顺滑语言掩盖论证缺口。

### 3. 最小必要修改

准确、清楚的原句可以保留。优先删除重复、修正术语和指代、调整必要句序、补清真实逻辑关系、降低无依据的强断言，并去除空洞评价和机械套话。长句妨碍理解时按核心判断拆分，再补清句间关系；不要为了显示修改量重写每句话。

### 4. 去除模板腔并恢复作者节奏

按 [自然化流程](references/humanization-pass.md) 做最多两遍有界编辑：第一遍处理聊天残留、空泛铺垫、意义膨胀、虚构对立、无来源权威和通用结尾；第二遍检查重复句式、连接词堆积、同义词轮换与机械节奏。单个词、被动语态、`we`、必要限定词、三项并列或某种标点都不是自动改写理由。

完整文件或较长章节应在可提取为 UTF-8 文本时运行：

```bash
python scripts/academic_prose_lint.py path/to/manuscript.txt
```

结果是人工复核线索，不是 AI 作者判定或验收分数。没有实质问题时保持原文，不通过反复改写、故意语病、随机标点或虚构个人经历制造所谓“人类感”。

### 5. 继承作者选择

同一任务中持续继承作者已确认的术语、结论强度、句长偏好、禁用表达和不修改区域。需要跨章节复用时，从 [示例 profile](assets/author-style-profile.example.json) 建立任务级文件并运行：

```bash
python scripts/check_author_profile.py path/to/author-style-profile.json
```

profile 是显式任务资料，不代表跨会话自动记忆。用户的新明确要求覆盖旧偏好，但不能覆盖科学事实。

### 6. 回核最终英文

对照原文、图表和可用证据复核数字、比较对象、方向、限定词、术语、时态、图号和引文。逐句检查主谓一致、句子完整性、冠词、单复数、介词、修饰关系和指代；拆句或重组后再次检查语法、时态与逻辑衔接。确认删减没有移除必要条件，重组没有改变时间或因果关系，中文转写没有增加新含义。

完整文件或较长章节应保存修改前后两个文本版本并运行：

```bash
python scripts/check_manuscript_preservation.py before.txt after.txt
```

该脚本只比较部分可机械保护的数值、单位、交叉引用、引文、公式、链接和直接引语。无论结果是否通过，仍须人工复核否定、归因、因果、不确定性、比较方向和研究范围。

## 输出

- 短文本：默认提供润色后的完整英文，再简要说明会影响理解的关键修改；用户要求只给修改稿时不附解释。
- 审核任务：区分确定问题与待确认风险，给出原文定位、原因和最小修复方案。
- 文档任务：沿用用户指定或原文件格式；只有用户要求时才生成修订痕迹、逐条对照或额外报告。
- 证据不足：指出需要补证据或降低强度的位置，不偷偷插入看似合理的引用。

## 完成条件

- 修改范围与用户要求一致，没有擅自扩写、从零续写或整章替换。
- 事实、数字、实体、图表和引文与可用材料一致。
- 观察、解释和推论层级清楚，结论强度由证据决定。
- 段落围绕明确问题展开，术语与缩写一致。
- 英文准确、直接、克制且自然，没有为“学术感”堆叠抽象词、套话或宣传式意义。
- 模板化模式已经结合上下文和作者样本复核；没有把模式命中误报成作者身份判断，也没有为了规避检测而制造噪声。
- 已检查长难句的阅读负担，并在拆句后复核语法、时态和逻辑衔接；没有因简化句式损失科学含义。
- 最终版本已经回读；未取得的证据和未完成的检查被如实说明。
